细胞类型蛋白质组

应用简介

传统蛋白质组学检测需要大块组织或大量细胞，检测结果只能反映蛋白质表达的整体水平。然而，随着我们对组织微环境的深入了解，我们需要对原代细胞的单细胞或单种细胞类型的超微量样本进行精准的蛋白质组学分析，以揭示不同细胞类型的蛋白质表达特征。这样，我们就能够识别出在特定生理或病理状态下，哪些细胞类型和蛋白质靶点发挥着重要作用。贝普奥生物推出的细胞类型蛋白质组学检测，通过结合流式细胞分选、SISPROT样本前处理技术和高分辨率质谱等先进科技，实现了对纳克级样本的高深度蛋白质组学分析，为我们打开了一个全新的视野，让我们能够从更细微的临床样本中探索和研究生命的奥秘。

技术特点

兼容组织、血液、体液等类型样本来源的分选细胞及多种培养细胞类型，尤其适合微量或较难获取的原代细胞或细胞亚型、珍贵临床样本等

每种细胞类型仅需1000个细胞即可实现高深度蛋白质组学检测

SISPROT® PAC试剂盒，助力单细胞蛋白质组学，定义超微量样本前处理新标准

20 ng处理量皮尔森相关系数均>0.93，CV值小于10%

技术流程

高纯度细胞类型获取

获取样本内特定细胞类型

样本前处理

通过SISPROT样本前处理技术，进行超微量样本的蛋白质组学前处理

质谱检测

使用超高分辨率的液相质谱平台，进行高深度蛋白质组学检测

生信分析

对质谱下机数据进行标准化生信分析，产生生信分析报告

应用领域

构建健康人血液免疫细胞蛋白质图谱

多发性骨髓瘤患者外周血T细胞蛋白质图谱

细胞类型蛋白质组结合空间蛋白质组解析胰腺癌肿瘤免疫微环境

构建健康人血液免疫细胞蛋白质图谱

2017年，Nature Immunology上发表了题“Social network architecture of human immune cells unveiled by quantitative proteomics”的文章中，通过流式细胞术和高深度蛋白质组学构建了健康人血液中存在的所有主要免疫细胞类型的蛋白质图谱，共检测超过10000种蛋白质。

多发性骨髓瘤患者外周血T细胞蛋白质图谱

2021年，Analytica Chimica Acta上发表了题为“Combinatory strategy using nanoscale proteomics and machine learning for T cell subtyping in peripheral blood of single multiple myeloma patients”的文章中，通过细胞类型蛋白质组构建了多发性骨髓瘤患者的8种外周血T细胞蛋白质表达图谱。

细胞类型蛋白质组结合空间蛋白质组解析肿瘤免疫微环境

2023年，bioRxiv上发布了题为“Multimodal single cell-resolved spatial proteomics reveals pancreatic tumor heterogeneity”的文章中，通过细胞类型蛋白质组学构建了胰腺癌组织中14种细胞类型的蛋白质表达谱。并进一步通过膜蛋白分析策略和空间解卷积算法准确预测了肿瘤和淋巴结构中9种免疫细胞亚型的比例。

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多维度蛋白质组学—互补平台

您可以通过细胞类型蛋白质组学获得不同细胞类型的精细化蛋白质表达信息，从而获得空间层面上细胞类型的比例，发现新细胞亚型。

空间可视化蛋白质组学

通过智能图像分析实现厘米级切片的个性化ROI圈选、单细胞分辨率的激光显微切割技术实现精准切割、独家专利的SISPROT样本前处理试剂盒实现纳克级超微量样本的蛋白质组学前处理，实现以空间视角，解析组织微环境。

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